通常肠胃炎唯一需要的治疗就是饮用足够的水，即使是让正在呕吐的病人饮用小量液体也有好处，除纠正其脱水外，还能起到止呕的作用。如果呕吐量较多、时间较长，病人出现严重脱水，则需要静脉输液，补充水和电解质。因为儿童更容易迅速脱水，所以应静脉输入含适当比例的糖盐水。市场上能购得的任何水电解质补液都有较好的治疗效果。但是，常用的饮料如汽水、茶、运动饮料和果汁不适合于腹泻的儿童。如果呕吐严重而影响服药，可给予注射或栓剂。
肠胃炎当症状有所改善后，可以逐渐增加清淡食物，如烹调过的燕麦片、香蕉、米饭、苹果泥、烤面包。如果饮食调整后12～24小时仍未减少腹泻，粪便检查也无血，未发现有严重细菌感染的证据，则可给予苯乙哌啶、洛哌丁胺或次水杨酸铋剂等药物。
因为抗生素本身能引起腹泻，还使细菌产生耐药性，故很少应用，甚至在已知胃肠炎是由某种细菌引起时仍可不用。但是，当病原是空肠弯曲菌、志贺菌和霍乱弧菌时，则要应用抗生素。
武汉国医堂医院胃肠科是省级重点科室，是湖北省唯一一家严格按照世界卫生组织诊疗规范设立的专业胃肠道疾病研究与诊疗中心，是一所集临床医学研究、临床信息采集胃肠病专病特色的防治机构，已经形成一套较完整的治疗胃肠疾病的有效方法。
武汉胃肠医院科室中西医结合，既有中医世家研发的“秘方”，同时引进国际先进的诊疗技术和设备，如湖北省独家引进“美国CTS胃肠三维无痛诊断系统”，真正实现胃肠病检查不插管、不下镜，并结合幽门螺杆菌检测和无痛电子肠胃镜，精确筛查胃肠癌；引进“欧姆纳米波疗法”、肠道透析疗法，独创40年国医之精粹“中西医平衡三维疗法”等专利治疗技术，形成了优越的技术特色和专业优势，被誉为“湖北省胃肠病第一品牌”。
